Форум программистов, компьютерный форум CyberForum.ru
Наши страницы

С++ для начинающих

Войти
Регистрация
Восстановить пароль
 
Aliru
0 / 0 / 0
Регистрация: 07.05.2013
Сообщений: 83
#1

Оптимизация поиска next_permutation - C++

09.12.2013, 18:06. Просмотров 232. Ответов 0
Метки нет (Все метки)

Есть последовательность 0 71 97 99 103 113 113 114 115 131 137 196 200 202 208 214 226 227 228 240 245 299 311 311 316 327 337 339 340 341 358 408 414 424 429 436 440 442 453 455 471 507 527 537 539 542 551 554 556 566 586 622 638 640 651 653 657 664 669 679 685 735 752 753 754 756 766 777 782 782 794 848 853 865 866 867 879 885 891 893 897 956 962 978 979 980 980 990 994 996 1022 1093
Вопрос состоит в том что надо найти все последовательности типа таких: 103-97-99-115-113-113-114-131-71-137 113-113-114-131-71-137-103-97-99-115
то есть 103 + 97 = 200 есть в последоваельности.
200 + 99 = 299 то же есть и так далее, но это должно выполнятся с каждой позиции, то есть - 99 + 115 = 214 то же есть, 214 + 113 = 327 ...
Но 99 + 71 = 170 его в последовательности и значит 99 и 71 не могут быть рядом в найденных последовательнастях
Я пробывал уже 3 варианта каждый работает или долго, или странно)))
Длину последовательности определяем в начале, но для простоты из примера я использовал 10 и занес это значение в enum/
Вот пример который работает очень долго
C++
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
// spectrum проверка.cpp : Defines the entry point for the console application.
//
 
#include "stdafx.h"
#include <iostream>
#include "conio.h"
#include "string"
#include "fstream"
#include "vector"
#include <algorithm>
 
using namespace std;
 
enum Kmer{k = 10};
 
void checkSequence(vector <int> &, vector <int> &, vector <int> &);
void M(vector <int> &);
 
int _tmain(int argc, _TCHAR* argv[])
{
    vector <int>Acid;
    vector <int>Protein;
    vector <int>Result;
    vector <int>Possible;
    unsigned int i = 0;
    ifstream Fin;
    Fin.open("d:\\dataset_22_4.txt");
    if (!Fin.is_open())
    {
        cout << "Can't open file-d:\\dataset_22_4.txt" << endl;
        exit(EXIT_FAILURE);
    }
    while (Fin.good())
    {
        Fin >> i;
        switch (i)
        {
        case 0:
            break;
        case 57:
        case 71:
        case 87:
        case 97:
        case 99:
        case 101:
        case 103:
        case 113:
        case 114:
        case 115:
        case 128:
        case 129:
        case 131:
        case 137:
        case 147:
        case 156:
        case 163:
        case 186:
            Acid.push_back(i);
            Result.push_back(i);
            Protein.push_back(i);
            cout << "AminoAcid has found" << endl;
            break;
        default:
            Protein.push_back(i);
            break;
        }
        Fin.get();
    }
    if (Fin.eof())
        cout << "EOF" << endl;
    else 
        if (Fin.fail())
        cout << "Fuck a duck, HAX!!!" << endl;
    else
        cout << "!!!---!!!" << endl;
    Fin.close();
 
    //End of input part
    Result.clear();
    do 
    {
        Possible.insert(Possible.end(),Acid.begin(),Acid.end());
        checkSequence(Protein,Possible,Result);
        //M(Possible);
        cout << "!!!" << endl;
        Possible.clear();
    } 
    while ( next_permutation(Acid.begin(),Acid.end()) );
    M(Result);
    _getch();
    return 0;
}
 
void M(vector <int> &W)
{
    for (unsigned int i = 0; i < W.size(); i++)
    {
        if (0 == i%10)
            cout << endl;
        cout << W.at(i) << '-';
    }
}
void checkSequence(vector <int> &PROTEIN, vector <int> &P, vector <int> &R)
{
    int count = 0;
    int possibleSequence = 0;
    int countPosition = 0;
        for (int u = 0; u < k; u++)
        {
            for (int y = countPosition; y < k + countPosition; y++ )
            {
                possibleSequence += P.at(y%k);
                for (unsigned int i = 0; i < PROTEIN.size(); i++)
                    if (possibleSequence == PROTEIN.at(i))
                    {
                        count++;
                        //break;
                    }
            }
            possibleSequence = 0;
            countPosition++;
        }
        if (count >= k*k)
                R.insert(R.end(),P.begin(),P.end());
}
Есть пример где изначально собирают цепочку по 1 штуке
C++
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
// spectrum.cpp : Defines the entry point for the console application.
//
 
#include "stdafx.h"
#include <iostream>
#include "conio.h"
#include "string"
#include "fstream"
#include "vector"
#include <algorithm>
 
using namespace std;
 
void checkSequence1(vector <int> &, vector <int> &, vector <int> &);
void checkSequence2(vector <int> &, vector <int> &, vector <int> &);
void addAminoAcid(vector <int> &, vector <int> &, vector <int> &);
void checkAA(vector <int> &A, vector <int> &P);
void M(vector <int> &);
void superCheckSequence(vector <int> &, vector <int> &);
 
int countAAA = 1;
int countCS = 2;
 
int _tmain(int argc, _TCHAR* argv[])
{
    vector <int>Acid;
    vector <int>Protein;
    vector <int>Result;
    /*int ar[10] = {137,103,97,99,115,113,113,114,131,71};
    vector <int>Result(ar,ar + 10);*/
    vector <int>Possible;
    unsigned int i = 0;
    ifstream Fin;
    Fin.open("d:\\dataset_22_4.txt");
    if (!Fin.is_open())
    {
        cout << "Can't open file-d:\\dataset_22_4.txt" << endl;
        exit(EXIT_FAILURE);
    }
    while (Fin.good())
    {
        Fin >> i;
        if (1093 == i)
            cout << "!!!!!!!!!!!!!!!!!!" <<endl;
        switch (i)
        {
        case 0:
            break;
        case 57:
        case 71:
        case 87:
        case 97:
        case 99:
        case 101:
        case 103:
        case 113:
        case 114:
        case 115:
        case 128:
        case 129:
        case 131:
        case 137:
        case 147:
        case 156:
        case 163:
        case 186:
            Acid.push_back(i);
            Result.push_back(i);
            Protein.push_back(i);
            cout << "AminoAcid has found" << endl;
            break;
        default:
            Protein.push_back(i);
            break;
        }
        Fin.get();
    }
    if (Fin.eof())
        cout << "EOF" << endl;
    else 
        if (Fin.fail())
        cout << "Fuck a duck, HAX!!!" << endl;
    else
        cout << "!!!---!!!" << endl;
    Fin.close();
 
    //End of input part
    cout << Protein.size()<< endl;
    Protein.pop_back();
    M(Protein);
    while ( countAAA <=9 )
    {
        addAminoAcid(Acid,Possible,Result);
        checkAA(Acid,Possible);
        checkSequence1(Protein,Possible,Result);
    }
    countCS--;
    checkSequence2(Protein,Possible,Result);
    /*for (int i = 0; i < Result.size(); i++)
    {
        if (0 == i%10)
            cout << endl;
        cout << Result.at(i) << '-';
    }*/
    ofstream f_out("d:\\Result.txt", ios::app);
        if (!f_out) 
            {
                cout<<"Файл Result.txt невозможно открыть";
                exit(EXIT_FAILURE);
            }
        for (i = 0; i < Result.size(); i++)
        {
            if (0 == i%10)
            {
                i += 30;
                f_out << endl;
            }
            f_out << Result.at(i);
            if (9 != i%10)
                f_out << '-';
        }
        f_out.close();
    _getch();
    return 0;
}
 
 
void M(vector <int> &W)
{
    for (int i = 0; i < W.size(); i++)
        cout << W.at(i) << endl;
}
void addAminoAcid(vector <int> &A, vector <int> &P, vector <int> &R)
{
    P.clear();
    for (int q = 0; q < (R.size()/countAAA); q++)
        {
                    for (int j = 0; j < A.size(); j++)
                    {
                        for (int a = q*countAAA; a < countAAA + q*countAAA; a++)
                            {
                                P.push_back(R.at(a));
                            }
                        P.push_back(A.at(j));
                    }
        }
    countAAA++;
}
void checkSequence1(vector <int> &PROTEIN, vector <int> &P, vector <int> &R)
{
    vector <int> XXX;
    R.clear();
    int possibleSequence = 0;
    for (int j = 0; j < P.size(); j += countAAA)
    {
        for (int i = j; i < j + countAAA; i++)
        {
            possibleSequence += P.at(i);
            XXX.push_back(P.at(i));
        }
        for (int k = 0; k < PROTEIN.size(); k++)
                if (possibleSequence == PROTEIN.at(k))
                {
                    //cout << "!!!" << endl;
                        R.insert(R.end(),XXX.begin(),XXX.end());
                        break;
                }
        possibleSequence = 0;
        XXX.clear();
    }
    countCS++;
    cout << countCS << endl;
}
 
void checkAA(vector <int> &A, vector <int> &P)
{
    int count=0;
    vector <int>AAA(A);
    vector <int>XXX;
    for (int i = 0; i < P.size()/countAAA; i++)
        {
            for (int a = i*countAAA; a < countAAA + i*countAAA; a++)
            {
                for (int y = 0; y < AAA.size(); y++)
                    if (P.at(a) == AAA.at(y))
                    {
                        AAA.erase(AAA.begin() + y);
                        count++;
                        break;
                    }
            }
            if (count == countAAA)
            {
                for (int a = i*countAAA; a < countAAA + i*countAAA; a++)
                    XXX.push_back(P.at(a));
            }
            AAA = A;
            count = 0;
        }
    P = XXX;
}
void superCheckSequence(vector <int> &P, vector <int> &R)
{
    vector <int>UUU;
    int Count = 0;
    bool X3 = true;
    for (int i = 0; i <= (R.size() - 10); i++)
    {
        for (int j = i + 1; (j < (i + 10 - 1) && X3 != false); j++) // 1 и 2 позиция корректны всегда
        {
            for (int k = 0; k < P.size(); k++)
            if ((R.at(j) + R.at(j + 1)) == P.at(k))
            {
                Count++;
                break;
            }
        }
        if (7 == Count)
            UUU.insert(UUU.end(),R.begin() + i,R.begin() + i + 10);
        Count = 0;
    }
    R = UUU;
}
//{
//  do 
//  {
//      Result.insert(Result.end(),Acid.begin(),Acid.end());
//  } 
//  while ( next_permutation(Acid.begin(),Acid.end()) );
//}
//void checkSequence(vector <int> &PROTEIN, vector <int> &P, vector <int> &R)
//{
//  vector <int> XXX;
//  int count = 0;
//  R.clear();
//  int possibleSequence = 0;
//  for (int j = 0; j < P.size(); j += countAAA)
//  {
//      for (int i = j; i < j + countAAA; i++)
//      {
//          XXX.push_back(P.at(i));
//      }
//      int countPosition = 0;
//      for (int u = 0; u < countCS*countCS; u++)
//      {
//          if (0 == (u%countCS))
//              possibleSequence = 0;
//          possibleSequence += XXX.at(u%countCS + countPosition++);
//          for (int k = 0; k < PROTEIN.size(); k++)
//              if (possibleSequence == PROTEIN.at(k))
//              {
//                  count++;
//              }
//          if (count == countCS*countCS)
//              {
//                  R.insert(R.end(),XXX.begin(),XXX.end());
//              }
//      }
//      count = 0;
//      possibleSequence = 0;
//      XXX.clear();
//  }
//  countCS++;
//  cout << countCS << endl;
//}
 
 
void checkSequence2(vector <int> &PROTEIN, vector <int> &P, vector <int> &R)
{
    vector <int> XXX;
    int count = 0;
    P = R;
    R.clear();
    int possibleSequence = 0;
    for (int j = 0; j < P.size(); j += countAAA)
    {
        for (int i = j; i < j + countAAA; i++)
        {
            XXX.push_back(P.at(i));
        }
        int countPosition = 0;
        for (int u = 0; u < countCS; u++)
        {
            for (int y = countPosition; y < countCS + countPosition; y++ )
            {
                possibleSequence += XXX.at(y%countCS);
                //cout << possibleSequence << '-';
                //cout << y << '-';
                for (int k = 0; k < PROTEIN.size(); k++)
                    if (possibleSequence == PROTEIN.at(k))
                    {
                        //cout << possibleSequence << '-'  << k << endl;
                        count++;
                        //break;
                    }
            }
            //cout << count << endl;
            possibleSequence = 0;
            countPosition++;
        }
        if (count >= countCS*countCS)
            {
                //cout << "!!!" << endl;
                R.insert(R.end(),XXX.begin(),XXX.end());
            }
        count = 0;
        possibleSequence = 0;
        XXX.clear();
    }
    countCS++;
    cout << countCS << endl;
}
и тоже не получается.
Подскажите какие еще есть варианты для решения задачи - хотя бы примерный алгоритм действий.
PS 3 недели пытаюсь решить
0
Надоела реклама? Зарегистрируйтесь и она исчезнет полностью.
Similar
Эксперт
41792 / 34177 / 6122
Регистрация: 12.04.2006
Сообщений: 57,940
09.12.2013, 18:06
Здравствуйте! Я подобрал для вас темы с ответами на вопрос Оптимизация поиска next_permutation (C++):

Оптимизация функции поиска - C++
Есть функция поиска номеров по шаблону, шаблон задает пользователь. Пример ввода: 097???????. Надо сделать так, чтоб при вводе (097???????...

Оптимизация поиска линейных конгруэнтных генераторов - C++
Здравствуйте! Хотел попросить помощи со следующим заданием: необходимо вернуть количество возможных линейных конгруэнтных генераторов...

Next_permutation - C++
Здравствуйте, Вот не понимаю, каким образом алгоритм next_permutation выполняет следующую большую перестановку. Он как-то генерирует...

Использование next_permutation - C++
Правильно ли я использую next_permutation? Мне нужно вывести все перестановки символов данной строки в алфавитном порядке. ...

Перестановки с next_permutation - C++
Есть входные данные 9-12 цифр надо из них создать все возможные перестановки и отправить их в вектор. Задумка do { ...

Перестановки next_permutation + map - C++
Есть большой кусок кода который я написал, попытался использовать перестановку для мапа, именно ключей в лексикографическом порядке...

0
MoreAnswers
Эксперт
37091 / 29110 / 5898
Регистрация: 17.06.2006
Сообщений: 43,301
09.12.2013, 18:06
Привет! Вот еще темы с ответами:

Next_permutation() и Time Limit - C++
Задача https://www.e-olymp.com/ru/problems/364 Мой код: #include &lt;bits/stdc++.h&gt; using namespace std; int main() { int...

Нужно отредактировать код поиска в некоторых папках. Добавить функцию поиска в архивах - C++
Нашёл одну программку, работает отлично, но вот не идёт поиск в таких местах как С:\users или C:\Windows Как это исправить?(желательно...

Поиска в записанном ранее файле по фамилии или по группе с выбором параметра поиска - C++
Нужно написать код для поиска в записанном ранее файле по фамилии или по группе с выбором параметра поиска. Помогите пожайлуйста, потому...

Организация поиска в списке. Исправить ошибку в методе поиска - C++
Сколько бы у меня желания не было, найти ее не могу. Может кто помочь? Заранее спасибо... #include &quot;stdafx.h&quot; #include &lt;iostream&gt; ...


Искать еще темы с ответами

Или воспользуйтесь поиском по форуму:
1
Ответ Создать тему
Опции темы

КиберФорум - форум программистов, компьютерный форум, программирование
Powered by vBulletin® Version 3.8.9
Copyright ©2000 - 2017, vBulletin Solutions, Inc.
Рейтинг@Mail.ru