Форум программистов, компьютерный форум CyberForum.ru

С++ для начинающих

Войти
Регистрация
Восстановить пароль
 
 
Рейтинг: Рейтинг темы: голосов - 33, средняя оценка - 4.91
Nikita2009
103 / 102 / 6
Регистрация: 12.09.2009
Сообщений: 453
#1

Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows - C++

12.09.2009, 21:14. Просмотров 4149. Ответов 17
Метки нет (Все метки)

Приветствую участников форума!

Я здесь новичек, поэтому прошу строго не судить.
Суть моей проблемы заключается в том что я не знаю с чего начать компиляцию исходника программы Gromacs (на Windows XP 32-bit).
Просьба также подсказать каким компилятором лучше пользоваться для начинающего... (В наличие есть Dev-C++, Microsoft Visual C++ 6.0).

Заранее благодарю за ответы...
После регистрации реклама в сообщениях будет скрыта и будут доступны все возможности форума.
zim22
depict1
276 / 141 / 2
Регистрация: 11.07.2009
Сообщений: 606
12.09.2009, 21:17     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows #2
Цитата Сообщение от Nikita2009 Посмотреть сообщение
Microsoft Visual C++ 6.0
поменять его Microsoft Visual C++ 2008
Цитата Сообщение от Nikita2009 Посмотреть сообщение
Суть моей проблемы заключается в том что я не знаю с чего начать компиляцию исходника программы Gromacs
c создания нового проекта и добавлением в него файлов Gromacs
Nikita2009
103 / 102 / 6
Регистрация: 12.09.2009
Сообщений: 453
12.09.2009, 21:31  [ТС]     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows #3
Спасибо за совет, но просьба подсказать какой именно нужно создавать проект (например: dll, exe и др.)

Загвоздка в том, что исходник Gromacs состоит из множества папок: admin, man, src, config, scripts, include, share, а также 10-ти файлов (Makefile, configure, instal и др.)
zim22
depict1
276 / 141 / 2
Регистрация: 11.07.2009
Сообщений: 606
12.09.2009, 22:27     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows #4
тыкнув пальцем в небо скажу, что win32 console application проект.
Nikita2009
103 / 102 / 6
Регистрация: 12.09.2009
Сообщений: 453
12.09.2009, 22:37  [ТС]     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows #5
А какие именно файлы туда "вкидывать"?
easybudda
Эксперт CЭксперт С++
9470 / 5483 / 927
Регистрация: 25.07.2009
Сообщений: 10,508
12.09.2009, 22:59     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows #6
Цитата Сообщение от Nikita2009 Посмотреть сообщение
А какие именно файлы туда "вкидывать"?
Если это оно:
Stable release 4.0.5 / 2009-05-09; 3 months ago
Written in C
Operating system Linux, Windows by Cygwin
Type Simulation
License GNU General Public License
Website http://www.gromacs.org/
то никакие VisualStudio использовать не прийдётся! Прийдётся установить cygwin (www.cygwin.com) обязательно вместе с компилятором gcc. Потом в cygwin-овской консоли перейти в папку с исходником и там
Код
./configure
make
make install
При определённой доле везения должно собраться и заработать. Но опять же исключительно в cygwin-консоли. Успехов!
Nikita2009
103 / 102 / 6
Регистрация: 12.09.2009
Сообщений: 453
12.09.2009, 23:44  [ТС]     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows #7
Вот что написано в инструкции для компилирования... (Gromacs 4.0.5)

инструкция
/* Only use this file if you are compiling Gromacs in a
* native Microsoft Windows Enviroment. You should NOT
* use it for cygwin.
*
* And, DO read this text before building things :-)
*
* First, if you are using visual C++ you could try to
* download the build workspace files from ftp.gromacs.org.
* You can find them in the pub/developer directory.
*
* Even if you are using the build workspace - first
* copy config.win to config.h in the src directory, and
* make sure the Gromacs version defined in that file is
* the same as in configure.ac.
*
* (Dont rename it since config.h can be overwritten
* by the configure script if you later use e.g. cygwin).
*
* You will also need the FFTW libraries for windows. Grab
* the precompiled version from ftp.gromacs.org/pub/developer,
* or use the build environment from the same place and compile
* it yourself. Place the libraries and include files somewhere
* where they are included automatically, e.g.
* \program files\Microsoft Visual Studio\VC98\Include,Lib
*
* I don't plan on updating the build environment, so you might
* find that filenames, etc, have changed. In that case, here's
* a short description of how to do it:
*
* Always define -DHAVE_CONFIG_H when you build, and include
* the current, src (..) and the include directories. Use optimization
* flags :-)
*
* 1. Build the innerloop generating program in the gmxlib
* directory. Use all the mkinl*.c sources and metacode.c
* Call the output program 'mkinl'.
*
* 2. Run it as 'mkinl c' to create the inner loops in
* the file innerc.c.
*
* 3. Compile gmxlib into a library. Look at the filelists
* in Makefile.am to see which files should be in it.
* In general, include everything except xml stuff
* (*xml*, it will have to wait for gmx4), powerpc specific
* stuff (*altivec*), motif stuff (*mgmx*, widget*),
* fortran files (f77*), and of course the innerloop files
* (mkinl*, metacode*). Don't use the fortran sources.
*
* Include the assembly file x86_cpuid.s. If you use
* single precision you should also use x86_sse.s and
* x86_3dnow.s, and for double prec. x86_sse2.s instead.
* To build these files you need the free 'nasm' assembler.
* You can find a version that supports extended 3dnow and sse
* at the gromacs ftp site. Use it like:
*
* nasm -f win32 x86_cpuid.s
*
* 4. Build the mdlib library from all the files in
* src/mdlib. Skip the fortran files (*.f).
*
* 5. Compile and link all the programs in kernel and
* tools. They should all be linked with the two
* libraries above. Look at the Makefile.am in each
* directory for descriptions of which files are
* included in each binary. For instance, mdrun consists of the files:
*
* glaasje.c gctio.c init_sh.c ionize.c do_gct.c relax_sh.c
* xutils.c md.c mdrun.c genalg.c
*/

/* You might have to update the version number in this file.
* To compile in double precision:
* 1) Define GMX_DOUBLE below
* 2) Check that we use the right FFTW name prefix for double below */

#define PACKAGE "gromacs"

#define VERSION "3.1.99"
/* #undef GMX_DOUBLE */

/* This is just the *default* library directory. Before looking here
* the program will try to find it relative to the location of the
* binary you are running. This is only used by grompp and other programs
* that create/edit topologies.
*/
#define GMXLIBDIR "C:\\program files\\gromacs\\share\\top"

/* Windows doesnt have SIGUSR, so we use SIGBREAK instead */
#define SIGUSR1 SIGBREAK

#define RETSIGTYPE void

#ifdef GMX_DOUBLE
# define FFTW_NAME_FFTW
#else
# define FFTW_NAME_SFFTW
#endif
/* You could also use FFTW_NAME_DFFTW for double prec,
* or FFTW_NAME_FFTW for single. You should get compiler warnings
* if your headers don't match, but we do not check the libraries.
*/

#define HAVE_LIMITS_H

#define HAVE_MEMORY_H

#define HAVE_STDLIB_H

#define HAVE_STRDUP

#define HAVE_STRING_H

#define HAVE_SYS_STAT_H

#define HAVE_SYS_TYPES_H

#define HAVE_VPRINTF

#define SOFTWARE_SQRT

#define STDC_HEADERS

/* Remove these defines to disable assembly loops */
#ifdef GMX_DOUBLE
# define USE_X86_SSE2
#else
# define USE_X86_SSE_AND_3DNOW
#endif

#define X_DISPLAY_MISSING

#define NO_PWUID

/* Pipe system calls */
#define popen _popen
#define pclose _pclose

/* not defined in sys/types on windows */
#define gid_t int

/* not defined in sys/types on windows */
#define uid_t int

/* No error function on windows, use our own */
#define erf(x) gmx_erf(x)
#define erfc(x) gmx_erfc(x)

#define inline __inline
Andrew_phase
0 / 0 / 0
Регистрация: 23.09.2009
Сообщений: 5
23.09.2009, 19:37     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows #8
[QUOTE=Nikita2009;265812]Вот что написано в инструкции для компилирования... (Gromacs 4.0.5)

не могли бы вы сказать, где можно скачать Gromacs 4.0.5 ? (под Windows XP
Заранее благодарен
Nikita2009
103 / 102 / 6
Регистрация: 12.09.2009
Сообщений: 453
23.09.2009, 20:45  [ТС]     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows #9
Такой версии еще нет под Виндовс нет.... Только 3 есть...
Ivan Ivanovich
2 / 2 / 0
Регистрация: 14.09.2009
Сообщений: 4
24.09.2009, 11:09     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows #10
На офсайте http://www.gromacs.org для работы под Windows доступны для скачивания несколько версий:
1. Работаем с Громаксом для Линукса, используя при этом для Винды эмулятор Линукса - Cygwin http://www.gromacs.org/index.php?tit...s/Cygwin_HOWTO.
2. Работаем под Виндовз без эмулятора - но версия старая 3.1.1. http://www.gromacs.org/index.php?tit...F%2FMS_Windows (самая нижняя версия)
И вот доступные для скачивания исходники http://www.gromacs.org/index.php?tit...6_Installation
Andrew_phase
0 / 0 / 0
Регистрация: 23.09.2009
Сообщений: 5
24.09.2009, 21:56     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows #11
Цитата Сообщение от Ivan Ivanovich Посмотреть сообщение
На офсайте http://www.gromacs.org для работы под Windows доступны для скачивания несколько версий:
1. Работаем с Громаксом для Линукса, используя при этом для Винды эмулятор Линукса - Cygwin http://www.gromacs.org/index.php?tit...s/Cygwin_HOWTO.
2. Работаем под Виндовз без эмулятора - но версия старая 3.1.1. http://www.gromacs.org/index.php?tit...F%2FMS_Windows (самая нижняя версия)
И вот доступные для скачивания исходники http://www.gromacs.org/index.php?tit...6_Installation

я скачал исходник gromacs-3.3.1.tar.gz с www.gromacs.ru. Достаточно ли будет его откомпилировать Visual Studio 2005 или потребуется что-либо ещё?
Anddry_
Сообщений: n/a
27.09.2009, 15:05     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows #12
Я тоже хочу скомпилировать GROMACS, причем на Visual Studio без всяких цигвинов и прочих недопингвинов. Нужно для визуальной отладки и возможности дописать свой код. (Просьба не указывать что лежит на оффсайте, это я и сам могу посмотреть)
Nikita2009
103 / 102 / 6
Регистрация: 12.09.2009
Сообщений: 453
27.09.2009, 17:26  [ТС]     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows #13
я скачал исходник gromacs-3.3.1.tar.gz с www.gromacs.ru. Достаточно ли будет его откомпилировать Visual Studio 2005 или потребуется что-либо ещё?
Я долго изучал этот вопрос, везде советуют использовать Cygwin
Andrew_phase
0 / 0 / 0
Регистрация: 23.09.2009
Сообщений: 5
28.09.2009, 17:28     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows #14
Цитата Сообщение от Nikita2009 Посмотреть сообщение
Я долго изучал этот вопрос, везде советуют использовать Cygwin
поставил cygwin-1.7. Затем скачал исходник gromacs-4.0.5.tar, распаковал его. Не подскажите, где можно взять (и как установить) gcc, чтобы его скомпилировать?
MoreAnswers
Эксперт
37091 / 29110 / 5898
Регистрация: 17.06.2006
Сообщений: 43,301
28.09.2009, 18:21     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows
Еще ссылки по теме:
Как скомпилировать программу? C++
C++ Как скомпилировать стороннюю библиотеку
Как это скомпилировать (hcxselect)? C++
Как скомпилировать в формат *.mix? C++
Как скомпилировать программу в CodeBlocks? C++

Искать еще темы с ответами

Или воспользуйтесь поиском по форуму:
Ivan Ivanovich
2 / 2 / 0
Регистрация: 14.09.2009
Сообщений: 4
28.09.2009, 18:21     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows #15
я скачал исходник gromacs-3.3.1.tar.gz с www.gromacs.ru. Достаточно ли будет его откомпилировать Visual Studio 2005 или потребуется что-либо ещё?
Боюсь что много "что-либо ещё"
Я тоже хочу скомпилировать GROMACS, причем на Visual Studio без всяких цигвинов и прочих недопингвинов.
Я этих пингвинов тоже терпеть не могу, тем более эмулятор для Громакса - это потеря производительности. Предлагаю вместе заняться компилированием GROMACS.
Я долго изучал этот вопрос
Я бы не останавливался на этом этапе, а начал бы заниматься собственно компилированием, поскольку на офсайте есть нормальная и рабочая версия GROMACS 3.1.1 под Виндовз откомпилированная живым человеком - что мешает откомпилировать 4.0.5? - множество вопросов....
Для начала есть инструкция для компилирования - находится в папке GROMACS\src\config.win - качаем, читаем и начинаем обсуждать.
А товарищу Nikita2009 рекомендуем присоединиться, включить в работу мозх и начинать думать
Yandex
Объявления
28.09.2009, 18:21     Как скомпилировать исходник Gromacs на Windows
Ответ Создать тему
Опции темы

КиберФорум - форум программистов, компьютерный форум, программирование
Powered by vBulletin® Version 3.8.9
Copyright ©2000 - 2017, vBulletin Solutions, Inc.
Рейтинг@Mail.ru