Не могу понять, как сгенерировать матрицу

# Открытое сообщение
text = input()
# Создание списка
text = [x for x in text]
# Поиск на одинаковые символы
for i in range(1,len(text)):
    if text[i] == text[i-1]:
        text.insert(i,"X")
# Если символов нечётное количество - прибавить 'X'
if len(text)%2 != 0:
    text.append("X")
# Если в текста символ 'J' - заменить на 'I'
for i in range(len(text)):
    if text[i] == "J":
        text[i] = "I"
# Создание матрицы с ключом 'CRYPT'
matrix = [
    ['C','R','Y','P','T'],
    ['A','B','D','E','F'],
    ['G','H','I','K','L'],
    ['M','N','O','Q','S'],
    ['U','V','W','X','Z']
]
print('Размер матрицы:',len(matrix))
# Деление текста по 2 символа
binary = []
k = ""
for i in text:
    k += i
    if len(k) == 2:
        binary.append(k)
        k = ""
 
# Шифрование
encrypt = ""; switch = 0
# Перебор двойных символов
for i in range(len(binary)):
    # k = 0 или k = 1 (Для разделения двойных символов)
    for k in range(2):
        # Перебор строк матрицы
        for x in range(len(matrix)):
            # Перебор символов в строке
            for y in range(len(matrix[x])):
                # Если символ из матрицы равен символу из открытого сообщения
                if matrix[x][y] == binary[i][k]:
                    # Если 0 и 1 символы открытого сообщения находятся на одной строке в матрице
                    if binary[i][0] in matrix[x] and binary[i][1] in matrix[x]:
                        # Если символ в матрице не равен началу матричной строки
                        if matrix[x][y] != matrix[x][-1]:
                            # То добавить к encrypt значение символа матрицы с отступом +1
                            encrypt += matrix[x][y+1]
                        # Иначе если символы 0 и 1 находятся на разных строках матрицы
                        else:
                            # То добавить к encrypt значение символа матрицы с отступом -4
                            encrypt += matrix[x][y-4]
                    # Иначе если символы 0 и 1 находятся на разных строках матрицы
                    else:
                        # Перебор строк матрицы
                        for a in range(len(matrix)):
                            # Перебор символов в строке
                            for b in range(len(matrix[a])):
                                # Если символ из матрицы равен символу 0 из зашифрованного сообщения
                                if matrix[a][b] == binary[i][0]:
                                    # Создать переменную x0, содержащую координату 0 символа
                                    x0 = a
                                # Если символ из матрицы равен символу 1 из зашифрованного сообщения 
                                if matrix[a][b] == binary[i][1]:
                                    # Создать переменную x1, содержащую координату 1 символа
                                    x1 = a
                        # Если переменная 'switch' равна нулю
                        if switch  == 0:
                            # Добавить к переменной decrypt координаты значения матрицы x1/y
                            encrypt += matrix[x1][y]
                            switch  = 1
                        # Иначе
                        else:
                            # Добавить к переменной decrypt координаты значения матрицы x0/y
                            encrypt += matrix[x0][y]
                            switch  = 0     
# Вывод зашифрованного сообщения на экран                
print("Encrypted message:",encrypt)
f=open('crypt.txt','w')
f.write(encrypt)
f.close()