Форум программистов, компьютерный форум, киберфорум
Python: Решение задач
Войти
Регистрация
Восстановить пароль
Блоги Сообщество Поиск Заказать работу  
 
Рейтинг 4.60/25: Рейтинг темы: голосов - 25, средняя оценка - 4.60
3 / 3 / 0
Регистрация: 20.12.2021
Сообщений: 105

Кодирование геномов

11.01.2022, 19:20. Показов 5637. Ответов 3
Метки нет (Все метки)

Студворк — интернет-сервис помощи студентам
Геномчик в последнее время заинтересовался передачей наследственной информации. Он узнал, что она кодируется в ДНК — молекуле, состоящей из двух связанных цепочек, каждая из которых состоит из азотистых оснований 4-х видов, попарно комплементарных: A (аденин) соответствует T (тимину), C (цитозин) соответствует G (гуанину).
Вам нужно написать функцию genome(), которая считает количество комплементарных пар нуклеотидов (азотистых оснований).
Аргументы функции — две строки с цепочками ДНК одинаковой длины. Функция возвращает кортеж — количество комплементарных пар и результат: если количество некомплементарных оснований меньше 30% суммарной длины двух строк, то вернуть True, иначе False.

(Некомплементарные основания могут быть в обеих строках, считаются 2 раза!)
Пример 1
Ввод:
line_1 = 'ATTCTTTTTTCATG'
line_2 = 'CCCCAGCGGAGATA'
print(*genome(line_1, line_2))

Вывод:
3 False

Пример 2
Ввод:
line_1 = 'TTTTTTGGCTC'
line_2 = 'AAAAAATCGAA'
print(*genome(line_1, line_2))

Вывод:
9 True
0
Лучшие ответы (1)
Programming
Эксперт
39485 / 9562 / 3019
Регистрация: 12.04.2006
Сообщений: 41,671
Блог
11.01.2022, 19:20
Ответы с готовыми решениями:

Кодирование массива
С помощью numpy написать функцию для кодирования массива (Run-length encoding). Все подряд повторения элементов функция сжимает в один...

Префиксное кодирование
Помогите, пожалуйста! Префиксное кодирование является очень распространенным способом сжатия информации для ее хранения и передачи....

Шифровки и дешифровки, кодирование
Составить программу шифрования текстового сообщения. Пользователь задает ключ шифровки - целое число, которое определяет величину смещения...

3
Эксперт PythonЭксперт Java
19530 / 11067 / 2931
Регистрация: 21.10.2017
Сообщений: 23,294
11.01.2022, 19:53
Python
1
2
3
def genome(line_1, line_2):
    count = sum([sorted(i) in [['A', 'T'], ['C', 'G']] for i in zip(line_1, line_2)])
    return count, count > (len(line_1 + line_2) * .3)
1
3 / 3 / 0
Регистрация: 20.12.2021
Сообщений: 105
12.01.2022, 10:12  [ТС]
iSmokeJC, с этим вводом не прокатывает
Ввод:
line_1 = 'TTAATC'
line_2 = 'AATAAT'
print(*genome(line_1, line_2))

Ожидаемый результат:
4 False

Вывод:
4 True
0
Эксперт Python
8851 / 4502 / 1864
Регистрация: 27.03.2020
Сообщений: 7,317
12.01.2022, 11:20
Лучший ответ Сообщение было отмечено DoberMan2001 как решение

Решение

Python
1
2
3
4
5
def genome(line_1, line_2):
    n = len(line_1)
    dct = {'A': 'T', 'T': 'A', 'C': 'G', 'G': 'C'}
    count = sum(dct[line_2[i]] != line_1[i] for i in range(n))
    return n-count, 10*count < 3*n
0
Надоела реклама? Зарегистрируйтесь и она исчезнет полностью.
inter-admin
Эксперт
29715 / 6470 / 2152
Регистрация: 06.03.2009
Сообщений: 28,500
Блог
12.01.2022, 11:20
Помогаю со студенческими работами здесь

Кодирование RLE на питон
Что не так? Почему не выводит строчку с кодированием? def rle_encode(data): #кодирование encoding = '' prev_char = '' ...

Задача. Кодирование контролем четности
Помогите выполнить, вообще не понимаю как это реализовать. Вводится k – число символов в блоке и последовательность двоичных символов,...

Кодирование
Добрый день! Прошу помощи, подсказки как именно реализовать через циклы! Тех кто будет помогать реализовывать не через циклы прошу...

Кодирование символов
Подключаю почту к проекту. Домен написан кириллицей и как я понимаю именно из-за этого возникла следующая ошибка: 'ascii' codec can't...

Кодирование повторов
Кодирование повторов – простой алгоритм сжатия данных, который оперирует сериями, то есть последовательностями, в которых один и тот же...


Искать еще темы с ответами

Или воспользуйтесь поиском по форуму:
4
Ответ Создать тему
Новые блоги и статьи
Настройки VS Code
Loafer 13.04.2026
{ "cmake. configureOnOpen": false, "diffEditor. ignoreTrimWhitespace": true, "editor. guides. bracketPairs": "active", "extensions. ignoreRecommendations": true, . . .
Оптимизация кода на разграничение прав доступа к элементам формы
Maks 13.04.2026
Алгоритм из решения ниже реализован на нетиповом документе, разработанного в конфигурации КА2. Задачи, как таковой, поставлено не было, проделанное ниже исключительно моя инициатива. Было так:. . .
Контроль заполнения и очистка дат в зависимости от значения перечислений
Maks 12.04.2026
Алгоритм из решения ниже реализован на примере нетипового документа "ПланированиеПерсонала", разработанного в конфигурации КА2. Задача: реализовать контроль корректности заполнения дат назначения. . .
Архитектура слоя интернета для сервера-слоя.
Hrethgir 11.04.2026
В продолжение https:/ / www. cyberforum. ru/ blogs/ 223907/ 10860. html Знаешь что я подумал? Раз мы все источники пишем в голове ветки, то ничего не мешает добавить в голову такой источник, который сам. . .
Подстановка значения реквизита справочника в табличную часть документа
Maks 10.04.2026
Алгоритм из решения ниже реализован на примере нетипового документа "ПланированиеПерсонала", разработанного в конфигурации КА2. Задача: при выборе сотрудника (справочник Сотрудники) в ТЧ документа. . .
Очистка реквизитов документа при копировании
Maks 09.04.2026
Алгоритм из решения ниже применим как для типовых, так и для нетиповых документов на самых различных конфигурациях. Задача: при копировании документа очищать определенные реквизиты и табличную. . .
модель ЗдравоСохранения 8. Подготовка к разному выполнению заданий
anaschu 08.04.2026
https:/ / github. com/ shumilovas/ med2. git main ветка * содержимое блока дэлэй из старой модели теперь внутри зайца новой модели 8ATzM_2aurI
Блокировка документа от изменений, если он открыт у другого пользователя
Maks 08.04.2026
Алгоритм из решения ниже реализован на примере нетипового документа, разработанного в конфигурации КА2. Задача: запретить редактирование документа, если он открыт у другого пользователя. / / . . .
КиберФорум - форум программистов, компьютерный форум, программирование
Powered by vBulletin
Copyright ©2000 - 2026, CyberForum.ru