Форум программистов, компьютерный форум, киберфорум
Python: Решение задач
Войти
Регистрация
Восстановить пароль
Блоги Сообщество Поиск Заказать работу  
 
Рейтинг 4.60/25: Рейтинг темы: голосов - 25, средняя оценка - 4.60
3 / 3 / 0
Регистрация: 20.12.2021
Сообщений: 105

Кодирование геномов

11.01.2022, 19:20. Показов 5564. Ответов 3
Метки нет (Все метки)

Студворк — интернет-сервис помощи студентам
Геномчик в последнее время заинтересовался передачей наследственной информации. Он узнал, что она кодируется в ДНК — молекуле, состоящей из двух связанных цепочек, каждая из которых состоит из азотистых оснований 4-х видов, попарно комплементарных: A (аденин) соответствует T (тимину), C (цитозин) соответствует G (гуанину).
Вам нужно написать функцию genome(), которая считает количество комплементарных пар нуклеотидов (азотистых оснований).
Аргументы функции — две строки с цепочками ДНК одинаковой длины. Функция возвращает кортеж — количество комплементарных пар и результат: если количество некомплементарных оснований меньше 30% суммарной длины двух строк, то вернуть True, иначе False.

(Некомплементарные основания могут быть в обеих строках, считаются 2 раза!)
Пример 1
Ввод:
line_1 = 'ATTCTTTTTTCATG'
line_2 = 'CCCCAGCGGAGATA'
print(*genome(line_1, line_2))

Вывод:
3 False

Пример 2
Ввод:
line_1 = 'TTTTTTGGCTC'
line_2 = 'AAAAAATCGAA'
print(*genome(line_1, line_2))

Вывод:
9 True
0
Лучшие ответы (1)
Programming
Эксперт
39485 / 9562 / 3019
Регистрация: 12.04.2006
Сообщений: 41,671
Блог
11.01.2022, 19:20
Ответы с готовыми решениями:

Кодирование массива
С помощью numpy написать функцию для кодирования массива (Run-length encoding). Все подряд повторения элементов функция сжимает в один...

Префиксное кодирование
Помогите, пожалуйста! Префиксное кодирование является очень распространенным способом сжатия информации для ее хранения и передачи....

Шифровки и дешифровки, кодирование
Составить программу шифрования текстового сообщения. Пользователь задает ключ шифровки - целое число, которое определяет величину смещения...

3
Эксперт PythonЭксперт Java
19530 / 11067 / 2931
Регистрация: 21.10.2017
Сообщений: 23,294
11.01.2022, 19:53
Python
1
2
3
def genome(line_1, line_2):
    count = sum([sorted(i) in [['A', 'T'], ['C', 'G']] for i in zip(line_1, line_2)])
    return count, count > (len(line_1 + line_2) * .3)
1
3 / 3 / 0
Регистрация: 20.12.2021
Сообщений: 105
12.01.2022, 10:12  [ТС]
iSmokeJC, с этим вводом не прокатывает
Ввод:
line_1 = 'TTAATC'
line_2 = 'AATAAT'
print(*genome(line_1, line_2))

Ожидаемый результат:
4 False

Вывод:
4 True
0
Эксперт Python
8849 / 4501 / 1864
Регистрация: 27.03.2020
Сообщений: 7,317
12.01.2022, 11:20
Лучший ответ Сообщение было отмечено DoberMan2001 как решение

Решение

Python
1
2
3
4
5
def genome(line_1, line_2):
    n = len(line_1)
    dct = {'A': 'T', 'T': 'A', 'C': 'G', 'G': 'C'}
    count = sum(dct[line_2[i]] != line_1[i] for i in range(n))
    return n-count, 10*count < 3*n
0
Надоела реклама? Зарегистрируйтесь и она исчезнет полностью.
inter-admin
Эксперт
29715 / 6470 / 2152
Регистрация: 06.03.2009
Сообщений: 28,500
Блог
12.01.2022, 11:20
Помогаю со студенческими работами здесь

Кодирование RLE на питон
Что не так? Почему не выводит строчку с кодированием? def rle_encode(data): #кодирование encoding = '' prev_char = '' ...

Задача. Кодирование контролем четности
Помогите выполнить, вообще не понимаю как это реализовать. Вводится k – число символов в блоке и последовательность двоичных символов,...

Кодирование
Добрый день! Прошу помощи, подсказки как именно реализовать через циклы! Тех кто будет помогать реализовывать не через циклы прошу...

Кодирование символов
Подключаю почту к проекту. Домен написан кириллицей и как я понимаю именно из-за этого возникла следующая ошибка: 'ascii' codec can't...

Кодирование повторов
Кодирование повторов – простой алгоритм сжатия данных, который оперирует сериями, то есть последовательностями, в которых один и тот же...


Искать еще темы с ответами

Или воспользуйтесь поиском по форуму:
4
Ответ Создать тему
Новые блоги и статьи
Подключение Box2D v3 к SDL3 для Android: физика и отрисовка коллайдеров
8Observer8 29.01.2026
Содержание блога Box2D - это библиотека для 2D физики для анимаций и игр. С её помощью можно определять были ли коллизии между конкретными объектами. Версия v3 была полностью переписана на Си, в. . .
Инструменты COM: Сохранение данный из VARIANT в файл и загрузка из файла в VARIANT
bedvit 28.01.2026
Сохранение базовых типов COM и массивов (одномерных или двухмерных) любой вложенности (деревья) в файл, с возможностью выбора алгоритмов сжатия и шифрования. Часть библиотеки BedvitCOM Использованы. . .
Загрузка PNG с альфа-каналом на SDL3 для Android: с помощью SDL_LoadPNG (без SDL3_image)
8Observer8 28.01.2026
Содержание блога SDL3 имеет собственные средства для загрузки и отображения PNG-файлов с альфа-каналом и базовой работы с ними. В этой инструкции используется функция SDL_LoadPNG(), которая. . .
Загрузка PNG с альфа-каналом на SDL3 для Android: с помощью SDL3_image
8Observer8 27.01.2026
Содержание блога SDL3_image - это библиотека для загрузки и работы с изображениями. Эта пошаговая инструкция покажет, как загрузить и вывести на экран смартфона картинку с альфа-каналом, то есть с. . .
Влияние грибов на сукцессию
anaschu 26.01.2026
Бифуркационные изменения массы гриба происходят тогда, когда мы уменьшаем массу компоста в 10 раз, а скорость прироста биомассы уменьшаем в три раза. Скорость прироста биомассы может уменьшаться за. . .
Воспроизведение звукового файла с помощью SDL3_mixer при касании экрана Android
8Observer8 26.01.2026
Содержание блога SDL3_mixer - это библиотека я для воспроизведения аудио. В отличие от инструкции по добавлению текста код по проигрыванию звука уже содержится в шаблоне примера. Нужно только. . .
Установка Android SDK, NDK, JDK, CMake и т.д.
8Observer8 25.01.2026
Содержание блога Перейдите по ссылке: https:/ / developer. android. com/ studio и в самом низу страницы кликните по архиву "commandlinetools-win-xxxxxx_latest. zip" Извлеките архив и вы увидите. . .
Вывод текста со шрифтом TTF на Android с помощью библиотеки SDL3_ttf
8Observer8 25.01.2026
Содержание блога Если у вас не установлены Android SDK, NDK, JDK, и т. д. то сделайте это по следующей инструкции: Установка Android SDK, NDK, JDK, CMake и т. д. Сборка примера Скачайте. . .
КиберФорум - форум программистов, компьютерный форум, программирование
Powered by vBulletin
Copyright ©2000 - 2026, CyberForum.ru