Реализация в виде консольного приложения с разбором параметров командной строки

package com.company;
 
import java.io.File;
import java.io.FileNotFoundException;
import java.util.Scanner;
import java.io.BufferedReader;
import java.io.BufferedWriter;
import java.io.BufferedReader;
import java.io.FileWriter;
import java.io.IOException;
import java.io.PrintWriter;
import java.io.FileReader;
import java.io.FileInputStream;
 
class Matrix01 {
    private String filePath;
    private int rowsCount;
    private int colsCount;
    private int matrixArray[][];
    private Scanner scanner;
    private int i,j;
 
 
    private static final String PATH = "D://output.txt";
    private static final String PATH_two = "D://output_two.txt";
    private static final String PATH_three = "D://output_three.txt";
    private static final String PATH_four = "D://output_four.txt";
    private static final String PATH_five = "D://output_five.txt";
 
    public Matrix01(String filePath) throws FileNotFoundException {
        this.filePath = filePath;
        this.scanner = new Scanner(new File(this.filePath));
        this.rowsCount = scanner.nextInt();
        this.colsCount = scanner.nextInt();
        this.matrixArray = null;
 
    }
 
    public void getMatrixFromFile() {
        matrixArray = new int[this.rowsCount][this.colsCount];
        for (int i = 0; i < this.rowsCount; i++) {
            for (int j = 0; j < this.colsCount; j++) {
                matrixArray[i][j] = scanner.nextInt();
            }
        }
    }
 
    public void printMatrix() {
        System.out.print("Исходная матрица: \n");
        if (matrixArray != null) {
            for (int i = 0; i < this.rowsCount; i++) {
                for (int j = 0; j < this.colsCount; j++) {
                    System.out.print(matrixArray[i][j] + " ");
                }
                System.out.println();
            }
        }
    }
 
    public void new_matrix() {
 
        System.out.print("Новая матрица: \n");
        int max = 0;
        int min = 0;
        int max_index = 0;
        int min_index = 0;
 
        for (j = 0; j < this.colsCount; j++) {
            int sum = 0;
            for (i = 0; i < this.rowsCount; i++) {
                sum += matrixArray[i][j];
                if (j < 1 || sum > max) {
                    max = sum;
                    max_index = j;
                }
                if (j < 1 || sum < min) {
                    min = sum;
                    min_index = j;
                }
            }
        }
 
 
        for (i = 0; i < this.rowsCount; i++) {
            int temp = matrixArray[i][min_index];
            matrixArray[i][min_index] = matrixArray[i][max_index];
            matrixArray[i][max_index] = temp;
        }
 
        for (i = 0; i < this.rowsCount; i++) {
            for (j = 0; j < colsCount; j++) {
                System.out.print(matrixArray[i][j] + " ");
            }
            System.out.print("\n");
        }
        System.out.print("\n");
    }
 
    public void output() {
        try (PrintWriter writer = new PrintWriter(new FileWriter(PATH))) {
            for (int i = 0; i < this.rowsCount; i++) {
                for (int j = 0; j < this.colsCount; j++) {
                    writer.print(matrixArray[i][j] + " ");
                }
                writer.print("\n");
            }
        } catch (IOException e) {
            System.err.println(e.getMessage());
        }
 
    }
}
 
class Matrix02 {
    private String filePath02;
    private int rowsCount02;
    private int colsCount02;
    private int matrixArray02[][];
    private Scanner scanner02;
 
    private static final String PATH_two = "D://output_two.txt";
    private static final String PATH_three = "D://output_three.txt";
    private static final String PATH_four = "D://output_four.txt";
    private static final String PATH_five = "D://output_five.txt";
 
    public Matrix02(String filePath) throws FileNotFoundException {
        this.filePath02 = filePath;
        this.scanner02 = new Scanner(new File(this.filePath02));
        this.rowsCount02 = scanner02.nextInt();
        this.colsCount02 = scanner02.nextInt();
        this.matrixArray02 = null;
 
    }
 
    public void getMatrixFromFile02() {
        matrixArray02 = new int[this.rowsCount02][this.colsCount02];
        for (int i = 0; i < this.rowsCount02; i++) {
            for (int j = 0; j < this.colsCount02; j++) {
                matrixArray02[i][j] = scanner02.nextInt();
            }
        }
 
    }
 
    public void printMatrix02() {
        System.out.print("Исходная матрица: \n");
        if (this.matrixArray02 != null) {
            for (int i = 0; i < this.rowsCount02; i++) {
                for (int j = 0; j < this.colsCount02; j++) {
                    System.out.print(matrixArray02[i][j] + " ");
                }
                System.out.println();
            }
        }
 
    }
 
    public void new_matrix02() {
        int i, j;
 
        System.out.print("Новая матрица: \n");
        int max = 0;
        int min = 0;
        int max_index = 0;
        int min_index = 0;
 
        for (j = 0; j < this.colsCount02; j++) {
            int sum = 0;
            for (i = 0; i < this.rowsCount02; i++) {
                sum += matrixArray02[i][j];
                if (j < 1 || sum > max) {
                    max = sum;
                    max_index = j;
                }
                if (j < 1 || sum < min) {
                    min = sum;
                    min_index = j;
                }
            }
        }
 
        for (i = 0; i < this.rowsCount02; i++) {
            int temp = matrixArray02[i][min_index];
            matrixArray02[i][min_index] = matrixArray02[i][max_index];
            matrixArray02[i][max_index] = temp;
        }
 
        for (i = 0; i < this.rowsCount02; i++) {
            for (j = 0; j < colsCount02; j++) {
                System.out.print(matrixArray02[i][j] + " ");
            }
            System.out.print("\n");
        }
        System.out.print("\n");
    }
 
    public void output02() {
        try (PrintWriter writer = new PrintWriter(new FileWriter(PATH_two))) {
            for (int i = 0; i < this.rowsCount02; i++) {
                for (int j = 0; j < this.colsCount02; j++) {
                    writer.print(matrixArray02[i][j] + " ");
                }
                writer.print("\n");
            }
        } catch (IOException e) {
            System.err.println(e.getMessage());
        }
    }
}
 
class Matrix03 {
    private String filePath;
    private int rowsCount;
    private int colsCount;
    private int matrixArray[][];
    private Scanner scanner;
 
    private static final String PATH_three = "D://output_three.txt";
    private static final String PATH_four = "D://output_four.txt";
    private static final String PATH_five = "D://output_five.txt";
 
    public Matrix03(String filePath) throws FileNotFoundException {
        this.filePath = filePath;
        this.scanner = new Scanner(new File(this.filePath));
        this.rowsCount = scanner.nextInt();
        this.colsCount = scanner.nextInt();
        this.matrixArray = null;
 
    }
 
    public void getMatrixFromFile03() {
        matrixArray = new int[this.rowsCount][this.colsCount];
        for (int i = 0; i < this.rowsCount; i++) {
            for (int j = 0; j < this.colsCount; j++) {
                matrixArray[i][j] = scanner.nextInt();
            }
        }
 
    }
 
    public void printMatrix03() {
        System.out.print("Исходная матрица: \n");
        if (this.matrixArray != null) {
            for (int i = 0; i < this.rowsCount; i++) {
                for (int j = 0; j < this.colsCount; j++) {
                    System.out.print(matrixArray[i][j] + " ");
                }
                System.out.println();
            }
        }
 
    }
 
    public void new_matrix03() {
        int i, j;
 
        System.out.print("Новая матрица: \n");
        int max = 0;
        int min = 0;
        int max_index = 0;
        int min_index = 0;
 
        for (j = 0; j < this.colsCount; j++) {
            int sum = 0;
            for (i = 0; i < this.rowsCount; i++) {
                sum += matrixArray[i][j];
                if (j < 1 || sum > max) {
                    max = sum;
                    max_index = j;
                }
                if (j < 1 || sum < min) {
                    min = sum;
                    min_index = j;
                }
            }
        }
 
        /*for (i = 0; i < this.rowsCount; i++) {
            int temp = matrixArray[i][min_index];
            matrixArray[i][min_index] = matrixArray[i][max_index];
            matrixArray[i][max_index] = temp;
        }*/
 
        for (i = 0; i < this.rowsCount; i++) {
            int temp = matrixArray[i][min_index];
            matrixArray[i][min_index] = matrixArray[i][max_index];
            matrixArray[i][max_index] = temp;
            for (j = 0; j < colsCount; j++) {
                System.out.print(matrixArray[i][j] + " ");
            }
            System.out.print("\n");
        }
    }
 
    public void output03() {
        try (PrintWriter writer = new PrintWriter(new FileWriter(PATH_three))) {
            for (int i = 0; i < this.rowsCount; i++) {
                for (int j = 0; j < this.colsCount; j++) {
                    writer.print(matrixArray[i][j] + " ");
                }
                writer.print("\n");
            }
        } catch (IOException e) {
            System.err.println(e.getMessage());
        }
 
    }
}
 
public class Main {
 
    public static void main(String[] args) {
        // write your code here
        Matrix01 matrix = null;
        Matrix02 matrix02 = null;
        Matrix03 matrix03 = null;
        try {
            matrix = new Matrix01("D://input.txt");
            matrix.getMatrixFromFile();
            matrix.printMatrix();
            matrix.new_matrix();
            matrix.output();
        } catch (FileNotFoundException exception) {
        }
 
       try {
            matrix02 = new Matrix02("D://input_two.txt");
            matrix02.getMatrixFromFile02();
            matrix02.printMatrix02();
            matrix02.new_matrix02();
            matrix02.output02();
        } catch (FileNotFoundException exception) {
        }
 
        try {
            matrix03 = new Matrix03("D://input_three.txt");
            matrix03.getMatrixFromFile03();
            matrix03.printMatrix03();
            matrix03.new_matrix03();
            matrix03.output03();
        } catch (FileNotFoundException exception) {
        }
 
    }
}