Поиск анаграмм в файле

import java.io.File;
import java.io.FileNotFoundException;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.PrintWriter;
import java.util.*;
 
 
public class FindAnagram {
 
    private boolean areAnagrams(String word1, String word2) {
        if (word1 == null || word2 == null || word1.length() != word2.length())
            return false;
        char[] ch1 = word1.toLowerCase().toCharArray();
        char[] ch2 = word2.toLowerCase().toCharArray();
        Arrays.sort(ch1);
        Arrays.sort(ch2);
        return Arrays.equals(ch1, ch2);
    }
 
    private boolean contains(Map<String, HashSet<String>> map, String word) {
        Set<String> keysSet = map.keySet();
        for (String key : keysSet) {
            if (areAnagrams(key, word))
                return true;
        }
        return false;
    }
 
    private String keyForAnagram(Map<String, HashSet<String>> map, String anagram) {
        Set<String> keysSet = map.keySet();
        for (String key : keysSet) {
            if (areAnagrams(key, anagram))
                return key;
        }
        return null;
    }
 
    public void findAnagrams(File from, File to) throws FileNotFoundException {
        Map<String, HashSet<String>> map = new HashMap<String, HashSet<String>>();
        Scanner sc = new Scanner(from, "Cp1251");
        PrintWriter out = new PrintWriter(new FileOutputStream(to));
 
        //чтение из файла в map
        while (sc.hasNextLine()) {
            String line = sc.nextLine();
           // String[] words = line.split("\\s+");
            String[] words = line.split("[,;:.!?\\s]+");
 
            for (String word : words) {
                if (!contains(map, word)) {
                    map.put(word, new HashSet<String>());
                    HashSet<String> set = map.get(word);
                    set.add(word);
 
                } else {
                    String key = keyForAnagram(map, word);
                    HashSet<String> set = map.get(key);
                    set.add(word);
                }
            }
        }      
 
        //запись из map в другой файл
        Set<String> keys = map.keySet();
        for (String key : keys) {
            if (map.get(key).size() > 1) {
                Set<String> anagrams = map.get(key);
                for (String anagram : anagrams) {
                    out.print(anagram + " ");
                }
                out.println();
            }
        }
        sc.close();
        out.close();
    }
 
    public static void main(String[] args) {
        try {
        File from = new File("C:\\file_from.txt");
        File to = new File("C:\\file_to.txt");
        new FindAnagram().findAnagrams(from, to);
        } catch(FileNotFoundException e) {
            System.out.println("File not found " + e.getMessage());
        }
    }
}

import java.util.Arrays;
 
public class Parser {
    private String word;
    private String signature;
 
    public Parser(String word) {
        this.word = word;
        char[] wordToCharArray = word.toLowerCase().toCharArray();
        Arrays.sort(wordToCharArray);
        signature = new String(wordToCharArray);
    }
 
    public String getWord() {
        return word;
    }
 
    public String getSignature() {
        return signature;
    }
}

 List<String> listOfWords = new ArrayList<String>();
 
        Scanner scanner = new Scanner(source, "UTF-8");
        while (scanner.hasNextLine()) {
            String line = scanner.nextLine();
            String[] words = line.split("[()…»«,;:.!?\\s]+");
            for (String word : words) {
                listOfWords.add(word);
            }
        }