Заменить совпадающие строки 1 вхождением данной строки

public static void main(String[] args) {
    int[][] source = {{1, 2, 3}, {4,5,6}, {4,5,6}, {1,2,3}};
 
    printSolution(source);
}
 
static void printSolution(int[][] source) {
    int[] flaggerCopy = initFlaggers(source);
    int[][] result = fillUniqueArray(source, flaggerCopy);
 
    System.out.println(Arrays.deepToString(result));
}
 
private static int[] initFlaggers(int[][] source) {
    int[] result = new int[source.length + 1];
 
    for (int i = 0; i < source.length - 1; i++) {
        if (!Arrays.equals(source[i], source[i + 1])) {
            increaseSize(result, i + 1, result[0]++);
 
            if (i == source.length - 2) increaseSize(result, i + 2, result[0]++);
        }
    }
 
    return result;
}
 
private static void increaseSize(int[] flaggerCopy, int index, int tmp) {
    flaggerCopy[index] = 1;
}
 
private static int[][] fillUniqueArray(int[][] source, int[] flaggerCopy) {
    int[][] result = new int[flaggerCopy[0]][source[0].length];
 
    int filler = 0;
    for (int i = 0; i < source.length; i++) {
        if (flaggerCopy[i + 1] == 1) {
            System.arraycopy(source[i], 0, result[filler], 0, source[0].length);
            filler++;
        }
    }
 
    return result;
}